سیزاپراید در تعدادی از بیماریها با علایم بازگشت غذا به مری (ریفلاکس) از قبیل دیس پپسی، ترش کردن و پس زدن غذا مفید است، همچنین هنگامی که تخلیه معده به تأخیر می افتد سودمند می باشد. این حالت در بعضی از بیماران دیابتی و کسانی که اسکلروز سیستمیک و نوروپاتی اتونومیک دارند اتفاق می افتد.