هالوتان ممکن است باعث سمیت کبدی به‌صورت یرقان خفیف تانکروز کبدی شود. داروهای بیهوشکننده همچنین ممکن است باعث اختلال درمهارتهای روانی ـ حرکتی شوند. هذیان وتوهم بعد از بیهوشی از عوارض نسبتاً شایع هالوتان است. هیپوکسمی، کاهش فشارخون و آریتمی گذرا نیز ممکن است بروز نماید. در کشورهای پیشرفته، از هالوتان در بیهوشی بالغین – مگر در موارد خاص با اندیکاسیون مشخص و اثبات شده – استفاده نمی‌شود و این دارو با جایگزین ها ی مناسب دیگری که هپاتوتوکسیسیتی کمتری دارند، جایگزین شده است.