پانکراتین به عنوان مکمل آنزیم های لوزالمعده برای هضم چربی ها و کربوهیدرات ها ، یعنی کمک به هضم غذا در اشخاص پیر ، ناتوان یا مبتلا به سوءهاضمه به علت کم کاری پانکراس مانند التهاب لوزالمعده (پانکراتیت) ، بیماری فیبروکیستیک لوزالمعده، برداشتن لوزالمعده و انسداد مجرا به علت سرطان لوزالمعده استفاده می شود.

همچنین این دارو در درمان استئاتوره (مدفوع چرب) ناشی از برداشتن تمام یا قسمتی از معده یا روده نیز استفاده می گردد.